Bitcoin APIのプロセス間呼び出し方法はもう決めましたか？ 簡単な方法としては、wxWidgetsが提供するソケットインターフェースがあります: http://docs.wxwidgets.org/trunk/overview_ipc.html。wxServerを実行しているBitcoinプログラムに対して、コマンドラインからbitcoin実行ファイルを呼び出すか、独自のwxClientアプリをコーディングしてアクセスできます。
もう一つの選択肢は、素のBSDソケットを使うことですね。
64ビットLinuxのBitcoinバイナリがあれば送ってもらえますか？ VPSでコンパイルしようとしましたが、メモリー不足になりました。32ビット版（ia32-libs使用）も試しましたが、共有ライブラリが見つかりませんでした。