SVN 上のバージョン 0.2.6 はデーモンとして実行でき、コマンドラインまたは JSON-RPC で制御できるようになった。
Linux では libgtk2.0-0 がインストールされている必要があるが、GUI が実行されている必要はない。うまくいけば、ウィンドウシステムがインストールされていなくても GTK をインストールできるだろう。
デーモンとして起動するコマンド： bitcoin -daemon [スイッチ…]
または、通常通り UI を実行しつつコマンドラインや JSON-RPC からも制御可能にするには、-server スイッチを使用する。
bitcoin -server [スイッチ…]
どちらのスイッチでも、127.0.0.1:8332 でローカルソケット接続を受け付ける HTTP JSON-RPC サーバーが実行される。ポートはループバックにバインドされ、ローカルマシンからのみアクセスできるが、実行中のユーザーだけでなくどのアカウントからでもアクセスできる。
コマンドラインから制御するには、インターフェースはスイッチなしのコマンド名の後にパラメーター（ある場合）を続ける。 bitcoin <コマンド> [パラメーター…]
例：
bitcoin getinfo
bitcoin getdifficulty
bitcoin setgenerate true
bitcoin stop
これはシンプルな JSON-RPC クライアントで、JSON の結果を表示する。コマンドのリストは rpc.cpp を参照してほしい。
Web アプリや自動化されたものは通常、コマンドラインではなく JSON-RPC を直接使用する。すべての主要言語に JSON-RPC ライブラリがある。PHP や Python のようなスクリプト言語では、構文はローカル関数を呼び出すのと同じくらい自然だ。