良い指摘だ。SSE2がなくても、生成をオフにすれば動かせると思う。
cryptopp/config.hの先頭に以下を追加するのはどうだろうか：
#if !defined(_M_X64) && !defined(x86_64) #define CRYPTOPP_DISABLE_SSE2 1 #endif
これにより32ビットビルドでSSE2が無効になる。（少なくともGCCまたはMSVCでは）
そう、ただmakefileで指定する方がいい。そうすれば、古いCPUを気にしない人は、ソースをいじらずにフラグを外すだけでSSE2サポートを有効にしてコンパイルできる。
CMakeビルドにも、それ用のCMakeプロパティを追加できる。